Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RLFQ13129 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RLFQ13129 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RLFQ13129 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RLFQ13129 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RLFQ13129 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RLFQ13129 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RLFQ13129 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RLFQ13129 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RLFQ13129 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RLFQ13129 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RLFQ13129 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms