Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HSPB3Q12988 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HSPB3Q12988 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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