Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXI1Q12951 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms