Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FOXD4Q12950 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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