Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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PTPRJQ12913 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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PTPRJQ12913 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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PTPRJQ12913 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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PTPRJQ12913 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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