Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYP4F3Q08477 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms