Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CXCL9Q07325 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms