Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PAX8Q06710 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms