Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms