Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms