Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GBE1Q04446 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GBE1Q04446 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms