Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPCQ03188 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPCQ03188 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms