Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GCNT1Q02742 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms