Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DSG1Q02413 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms