Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC6A3Q01959 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms