Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SPTBN1Q01082 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms