Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLTCQ00610 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms