Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTRA4P83105 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms