Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SSBP2P81877 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms