Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIM1P81133 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIM1P81133 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIM1P81133 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms