Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SKP1P63208 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKP1P63208 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms