Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UFM1P61960 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
UFM1P61960 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UFM1P61960 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UFM1P61960 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UFM1P61960 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UFM1P61960 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UFM1P61960 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UFM1P61960 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UFM1P61960 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UFM1P61960 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms