Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVPABLB-1P60509 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms