Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJA9P57773 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJA9P57773 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJA9P57773 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJA9P57773 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms