Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTBP2P56545 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTBP2P56545 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTBP2P56545 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms