Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA4P54764 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms