Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AP3M2P53677 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms