Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC3P51654 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC3P51654 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC3P51654 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC3P51654 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC3P51654 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC3P51654 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1023.5 ms