Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DAP3P51398 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DAP3P51398 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DAP3P51398 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DAP3P51398 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DAP3P51398 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DAP3P51398 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DAP3P51398 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DAP3P51398 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DAP3P51398 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DAP3P51398 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DAP3P51398 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms