Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MRE11P49959 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRE11P49959 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRE11P49959 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRE11P49959 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRE11P49959 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRE11P49959 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRE11P49959 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRE11P49959 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRE11P49959 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRE11P49959 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRE11P49959 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRE11P49959 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRE11P49959 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRE11P49959 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms