Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLK1P49759 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLK1P49759 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLK1P49759 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms