Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPFP49454 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPFP49454 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPFP49454 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CENPFP49454 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms