Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA4P48169 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms