Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CHRNA4P43681 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHRNA4P43681 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms