Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCAMP43121 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCAMP43121 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCAMP43121 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MCAMP43121 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCAMP43121 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCAMP43121 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCAMP43121 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCAMP43121 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCAMP43121 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCAMP43121 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCAMP43121 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCAMP43121 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCAMP43121 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCAMP43121 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCAMP43121 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MCAMP43121 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCAMP43121 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCAMP43121 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCAMP43121 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCAMP43121 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCAMP43121 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCAMP43121 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCAMP43121 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCAMP43121 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCAMP43121 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MCAMP43121 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms