Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LTBRP36941 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LTBRP36941 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LTBRP36941 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms