Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5C1P36542 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATP5C1P36542 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms