Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms