Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CD40LGP29965 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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