Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CNTFRP26992 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms