Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
IL3RAP26951 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IL3RAP26951 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms