Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLR2AP24928 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms