Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIG1P18858 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIG1P18858 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIG1P18858 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIG1P18858 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIG1P18858 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIG1P18858 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIG1P18858 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LIG1P18858 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIG1P18858 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIG1P18858 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIG1P18858 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms