Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRAP18433 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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