Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM1P13688 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms