Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPREB1P12018 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms