Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
C4BP0C0L5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C4BP0C0L5 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms