Protein–RNA interactions for Protein: P05026

ATP1B1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B1P05026 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP1B1P05026 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms