Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSF2P04141 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSF2P04141 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms