Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRMUO75648 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRMUO75648 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRMUO75648 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRMUO75648 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRMUO75648 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRMUO75648 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRMUO75648 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms